Oder das Loch für die LED einfach bisschen größer, und so schräg wies halt sein muss, damit man am Stamm vorbei kommt, einbohren. Dann beim Einkleben die LED entsprechend ausrichten. Knetmasse reindrücken, LED dazu, ausrichten, und als Abschluss bisschen Epoxy rein. Oder die LED mit ner kleinen Metallplatte vor das relativ große Loch schrauben. Könnte auch gut aussehen für die die genauer hinsehen.
Den Kabelkanal ruhig auch großzügiger und freihand bohren. Dann kommts auch nicht mehr auf den Millimeter an, und wenn im Stamm ein bisschen rumgematscht wurde sieht das ja im fertigen Zustand kein Mensch.