Wenn Du extrudierst, kannst Du doch auswählen, ob der Körper beschnitten, erweitert oder ein neuer Körper erstellt werden soll.
Alternativ schon in der Skizze beide Rechtecke zeichnen, dann kannst Du entweder die nicht benötigten Linien "stutzen" oder wählst beim extrudieren nur den benötigten...